A Növények Génmegőrző Intézete teljes körű növényi génmegőrzési tevékenységet végez, így ellátja a hazai kultúrnövény génforrás-megőrzés bázisintézményi feladatait, a haszonnövények és vad növényfajok génforrásainak genetikai tartalékként történő megőrzését, végzi a szántóföldi, zöldségnövény, gyümölcs és szőlő, valamint a hazai kultúr- és természetes flóra genetikai erőforrásainak felkutatását, felmérését és gyűjtését, különös tekintettel a magyar tájfajtákra és a hazai flóra mezőgazdasági, élelmezési, illetve természetvédelmi szempontból fontos elemeire. Gondoskodik a ritka és kipusztulással fenyegetett hagyományőrző szántóföldi, zöldségnövény, gyümölcstermő növény, szőlő- és dísznövény fajták és tájfajták fenntartásáról és szaporítóanyaguk előállításáról.

Az Agrárminisztérium számára technikai és szakmai támogatást nyújt a hazai növényi génmegőrzési stratégia kialakításához és megvalósításához, a nemzetközi génbank szabványok hazai bevezetéséhez és a hazai növényi génbank tevékenységek szakmai feltételrendszerének összeállításához.

Kialakítja és működteti a hazai génbank gyűjteményekben folyó tevékenységeket megalapozó Nemzeti Génbank Adatbázist, az Országos Bázis Tárolót, valamint az Országos Biztonsági Duplikátum Tárolót. Feladata továbbá a hazai növényi génmegőrzéshez kapcsolódó hazai és nemzetközi együttműködési programok koordinálása, a nemzetközi együttműködési programokban való magyar részvétel megszervezése.

A Haszonállat-génmegőrzési Intézet ellátja a hazai és nemzetközi tenyésztési-génmegőrzési és koordinációs feladatokat az őshonosként védett magyar haszonállatfajták (kiemelten a kisállatfajták és a pannon méh) védelme és az érintett hazai tenyésztő szervezetek szakmai támogatása érdekében. Ennek keretében nemzeti génmegőrzési és génbanki hálózatot alakít ki és koordinál, létrehozza és működteti a kapcsolódó országos és regionális adatbázist és informatikai hátteret.

Magyar baromfi génbankot tart fenn és fejleszt, és más, különösen veszélyeztetett magyar haszonállat fajtákkal kapcsolatos génbanki, génvédelmi, génmegőrzési és génmentési tevékenységet végez.

A haszonállat-fajtavédelemhez, génmegőrzéshez, génbanki tevékenységhez és állattenyésztéshez kapcsolódó kutatás-fejlesztési és innovációs tevékenységet, valamint a fajtavédelemhez, növényi és állati biológiai alapokhoz, génmegőrzéshez, génbanki tevékenységhez és állattenyésztéshez kapcsolódó vidékfejlesztési, oktatási és ismeretterjesztő tevékenységet végez.